La validación de las herramientas webmaster de google se realiza de dos formas:

Agregar un meta en el header de tu web, el mismo que debes agregar en el header.php de tu theme; sin embargo este tipo de verificación casi siempre da algún tipo de error.

La segunda y ultima forma es subir un archivo de verificación al root de tu server (public_html), el archivo de verificación es descargable.

Respondiendo a tu pregunta si es posible acceder a través el FTP, pues claro que si, siempre y cuando tu blog esté alojado en un servidor propio sea este gratuito o de pago, ya que sólo así tendrías los datos de acceso al FTP, si esto es ásí solo debes navegar a la carpeta del thme de blog que se encuentra en tu instalación de wordpress esto es: wp-content/themes/tu-theme

NOTA: Para tener acceso a las herrramientas webmaster de google no es necesario crear primero una cuenta en analytics, ya que puedes acceder a ellas simplemente con tu cuenta de gmail si la tuvieras, donde después de registrar tu actual correo, deberás crear o asignar el sitio web, verificar la propiedad y luego hacer lo que tengas que hacer, antes o después puedes registrarte en google analytics.