La culpable es la función the_excerpt que filtra todos esos códigos. A no ser que modifiques o crees tu propia función the_excerpt, lo más fácil es usar [url=http://codex.wordpress.org/Customizing_the_Read_More]the_content[/url] (lee el último ejemplo) o limitar el número de palabras a mostrar bien con algún plugin o con tu propia función. Para los efectos es como hacer un resumen también.

Lo pones en el archivo search.php y los que usen the_excerpt.

Un saludo