Según se ha comentado también en la nota sobre WordPress 2.8 y su inminente lanzamiento, WordPress 2.9 requerirá disponer de MySQL 4.1.2 o superior instalado en el servidor. De hecho el actualizador de WordPress comprobará que se dispone de esta versión y avisará de que es necesaria si no estuviera instalada. Es más, el actualizador también informará de la conveniencia de tener instalado PHP 5 si no estuviera disponible, no será un requisito pero si una recomendación.
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AVISO: Esta publicación es de hace 3 años o más. Si es un código o un plugin podría no funcionar en las últimas versiones de WordPress, y si es una noticia podría estar ya obsoleta. Luego no digas que no te hemos avisado.
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Un host medianamente bueno estaria contanto con esos requisitos.
Hostgator (en mi caso) ya esta utilizando MySQL 5.1
en algún momento hay que dar el salto, es como los 64 bits en los sistemas operativos en algún momento hay que cortar y Os X de Apple lo hará en septiembre. Hay que evolucionar hacia el futuro.